10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）于线揭晓中国科学院微生物研究所微生物质源与年夜数据中央、世界微生物数据中央马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the archiving, standardization and analysisof microbiome data的研究论文。gcMeta平台是一个微生物基因组及微生物组数据的治理、阐发以及发布平台，为海内外用户提供一站式的从数据存储、数据阐发到数据发布的办事，今朝已经经整合了来自中科院微生物组规划及海内外多个主要工程的数据。该平台的发布将有用支撑我国微生物组研究并为将来我国国度微生物组规划的实行提供主要的撑持。 最近几年来，美国、欧盟都陆续启动了微生物组相干的研究工程。但微生物组年夜数据的网络、存储、功效挖掘以及开发哄骗始终是制约微生物组成长的焦点问题。我国今朝于微生物组数据治理中存于着尺度不同一、缺少跨范畴的数据整合、高品质的参考数据库以及数据的深度挖掘技能等问题。2017年，中科院启动了 中国微生物组规划 工程，工程旨于进一步强化中科院于微生物组研究以及开发哄骗等方面的共性技能以及平台上风，聚焦 人体康健以及情况 微生物组，开发响应的微生物组学新要领、新技能；经由过程研究其布局与功效、群体间的竞争与互助，微生物组与人体等宿主以及情况彼此作用及与宿主的寄生共生康健发育等瓜葛，发明微生物与人类以及情况配合演化的科学纪律。同时，也将于微生物组数据尺度化的根蒂根基上，成立微生物组年夜数据计较、存储以及同享平台，开发微生物组年夜数据挖掘的新要领，实现我国微生物组数据资源的体系治理以及高效哄骗。 gcMeta成立了一个微生物基因组、元基因组以及转录组治理、数据于线阐发、可视化及数据发布的一站式体系。今朝已经经整合来自国际相干平台（NCBI、EBI、MG-RAST等）及主要工程（HMP、Tara等）跨越12万样本数据，来自我国科学家的跨越2000余个样本数据，总数据量跨越120TB。平台为用户提供了多级的数据治理以及权限节制系统，可用在各研究组治理未揭晓数据，并于研究组内同享，也能够将内部治理数据举行于线发布与公然。平台为所有公然数据提供基在Persistent Identifier (PID) (http://www.pidconsortium.eu/)体系的独一PID号，用在于学术期刊的公然揭晓及后续数据援用及阐发。此外，平台还整合了跨越90个于线数据阐发东西，提供针对于扩增子序列、全基因组序列等4套阐发事情流，所有的阐发东西以及事情流都因此web体式格局使用，利便微生物范畴用户倏地把握及使用。用户可以经由过程该平台利便地实现数据治理、数据阐发、成果展示以及数据发布等一系列办事，平台也将为用户提供全历程的使用撑持，接待海内外用户使用该平台。 微生物质源与年夜数据中央史文聿、亓合媛为论文配合第一作者，微生物����APP质源与年夜数据中央及世界微生物数据中央马俊才及吴林寰为论文配合通信作者。该研究获得中科院重点部署工程 人体与情况康健的微生物组共性技能研究 、国度重点研发规划 益生菌康健功效与基在肠道微生物组学的食物养分代谢机理研究 、中科院A类先导专项 地球年夜数据 、中科院信息化专项微生物范畴云工程等的撑持。 相干论文信息：https://doi.org/10.1093/nar/gky1008 图1：用户数据治理、数据阐发及数据发布流程 图2：gcMeta数据治理体系及主页 图3：gcMeta数据阐发及可视化体系

出格声明：本文转载仅仅是出在流传信息的需要，其实不象征着代表本消息网不雅点或者证明其内容的真实性；如其他媒体、消息网或者小我私家从本消息网转载使用，须保留本消息网注明的 来历 ，并自大版权等法令义务；作者假如不但愿被转载或者者接洽转载稿费等事宜，请与咱们联系。/乐鱼 上一篇:乐鱼美国驻华大使：中美加强合作解决阿片类药物危机—新闻—科学网 下一篇:乐鱼科学家揭示结直肠癌T细胞动态变化—新闻—科学网